|
Czech National Team Projekty
|
Právě je pondělí, 13.ledna 2025, 15:09 hod.
|
Menu |
Seznam projektů |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Lattice |
|
|
|
|
|
|
|
Multiprojekty |
Beta
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
The Lattice Project |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
http://boinc.umiacs.umd.edu/ |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Stav projektu |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Aplikace |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Popis |
|
|
|
|
|
Jedná se o projekt vědců z University of Maryland. Jejich cílem je vytvořit výpočetní základnu a díky ní pomáhat společenství vědeckých výzkumů. Projekt by tedy měl tvořit jakousi základnu pro využití různých typů vědeckých aplikací.
Tím je dána i velká odlišnost práce na projektu a to jak nároky na hardware, tak i délka výpočtu, která by se měla pohybovat od pár minut až po několik dní. Všechny výpočty v rámci tohoto projektu budou součástí akademických vědeckých výzkumů. Všechny tyto výzkumy jsou nevýdělečné a financované z grantů a státních dotací. |
|
|
|
|
|
|
Kreditové hodnocení |
|
|
|
|
|
GARLI Počáteční počet replikací | 2 | Kreditový systém | benchmark s validací (asi nějak upravený o FLOPS, na lepších strojích vychází lépe než standardní) | Přidělený kredit | něco mezi nižším a vyšším požadovaným | Pro aplikace HMMPfam a MARXAN není známo |
|
|
|
|
|
|
Novinky na projektu |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Podprojekty |
|
|
|
|
|
|
GARLI |
Fórum |
Biologie |
|
|
Phylogenetic Analysis - GARLI
Fylogeneze nebo také fylogenetický vývoj je vývoj druhů organismů v historickém sledu ve smyslu evoluční teorie. Podle toho, jak se ubírala fylogeneze, se dnes tvoří stromy příbuznosti druhů.
Fylogenetický strom ("strom života") je grafické zobrazení připomínající strom, jímž se znázorňují příbuzenské vztahy mezi různými biologickými druhy či jinými taxonomickými jednotkami, o nichž se předpokládá, že mají jednoho společného předka. Každé větvení (uzel) představuje hypotetického posledního společného předka. Každá větev znamená jednu evoluční linii, na jejichž konci jsou dané taxony.Podle stupně příbuznosti dílčích taxonů se rozeznává polyfyletický, parafyletický a monofyletický taxon. Projekt se zabývá právě sestavováním těchto fylogenetických stromů, prostřednictvím analýzi nukleotidů a aminokyseli.
Momentálně probíhá výzkum druhu Lepidoptera, tedy motýlů a můr. |
|
|
Systémové požadavky :
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
HMMPfam |
Fórum |
Biologie |
|
|
Protein Sequence Comparison - HMMPfam
Projekt vyhledává a porovnává podobné sekvence aminokyselin, aby tak sestavil skupiny bílkovin s podobnou funkcí u příbuzných organismů. Tyto sekvence jsou pečlivě roztříděny podle kmenů, druhů, funkcí bílkovina dalších taxonomických skupin.
Toto třídění výrazně pomáhá v další výzkumu bílkovin. |
|
|
Systémové požadavky :
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
MARXAN |
Fórum |
Biologie |
|
|
Conservation Reserve Network Design - MARXAN
Projekt se zabývá vyhledáváním vhodných paramentrů pro vytvoření rezervy zachování některých živočišných druhů. Tento výzkum by měl mít přínos jak po stránce ekonomické, tak i ekologické. |
|
|
Systémové požadavky :
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Související odkazy |
|
|
|
|
|
|
Výzkumné podprojekty projektu Lattice |
|
|
|
GARLI - Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference |
|
|
|
HMMER - biosequence analysis using profile hidden Markov models |
|
|
|
Marxan - Informing Conservation Decision Globally |
|
|
|
|
|
|
Statistiky |
|
|
|
|
|
Tým |
Jednotlivci |
Stav |
Počet |
Kredit |
Rac |
05.05.2017 |
330 |
14.585.399,67 |
225,78 |
za 1 den |
0 |
0,00 |
0,00 |
za 7 dní |
0 |
0,00 |
0,00 |
za 30 dní |
0 |
0,00 |
0,00 |
Kdo a kdy přišel/odešel z našeho týmu na tomto projektu
|
Top10 podle Kreditu |
Kredit |
Rac |
Shaman |
5.313.042,54 |
1,35 |
BEKO |
1.406.616,28 |
0,09 |
koll |
1.147.110,99 |
0,09 |
nenym |
1.005.169,17 |
0,09 |
vinn@[CNT] |
1.000.269,96 |
0,09 |
fake |
561.679,57 |
0,09 |
Klouda |
541.605,23 |
0,76 |
1scorpion |
307.686,67 |
0,08 |
Vit Kliber |
261.945,30 |
0,53 |
Hanbanaroda |
220.092,93 |
0,09 |
Top10 podle Rac |
Kredit |
Rac |
mqk |
7.556,65 |
172,82 |
killik |
169.546,73 |
19,99 |
DaMaSig |
13.516,94 |
1,37 |
Shaman |
5.313.042,54 |
1,35 |
Klouda |
541.605,23 |
0,76 |
FalconCZ |
203.449,06 |
0,67 |
Vit Kliber |
261.945,30 |
0,53 |
wertykal |
1.956,91 |
0,45 |
Panx |
2.297,02 |
0,36 |
Johnbodlis team |
81.491,38 |
0,32 |
|
|
|
|
|
|
|
|
Grafy |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
https://projekty.czechnationalteam.cz |
|
|
|
|
|
|
|
|